Задачами отдела методологии информационных систем являются:

• сопровождение и интеграция информационных и информационно-аналитических систем министерства на основе современных достижений информационных и телекоммуникационных технологий;
• системная интеграция, внедрение и сопровождение информационных ресурсов министерства для автоматизации процессов хранения, обработки данных и получения оперативной информации об исполнении областного бюджета и бюджетов муниципальных образований на территории Амурской области;
• определение нужд министерства в сфере автоматизированных систем, обеспечивающих осуществление бюджетного процесса;
• внедрение и сопровождение специализированного программного обеспечения;
• организация процессов электронного документооборота министерства на базе автоматизированных систем осуществления бюджетного процесса области.

• готовит предложения по проведению закупок товаров, работ, услуг, целесообразности заключения государственных контрактов и договоров в части информационных систем, обеспечивающих осуществление бюджетного процесса;
• контролирует результаты исполнения государственных контрактов и договоров в части информационных систем, обеспечивающих осуществление бюджетного процесса;
• исполняет функцию организатора автоматизированного взаимодействия министерства с главными распорядителями областного бюджета и финансовыми органами муниципальных образований в рамках информационной системы сбора и консолидации отчетности в соответствии с нормативными требованиями для предоставления сводной отчетности в соответствующие органы;
• исполняет функцию организатора автоматизированного взаимодействия министерства с областными государственными учреждениями и муниципальными образованиями в сфере планирования бюджетов;
• разрабатывает проекты нормативных правовых актов области по вопросам, относящимся к компетенции отдела;
• контролирует и анализирует показатели полученных Сведений об использовании информационно-коммуникационных технологий (отчета ф. 0503177) для формирования Пояснительной записки к квартальному Отчету об исполнении областного бюджета;
• исполняет техническую работу по администрированию и настройке информационных систем министерства, в части осуществления бюджетного процесса, для обеспечения технологического процесса обработки информации служащими министерства;
• выполняет мероприятия по мобилизационной подготовке в соответствии с Перечнем задач и функций по мобилизационной подготовке и мобилизации;
• осуществляет методологическую поддержку пользователей систем автоматизации бюджетного процесса в области;
• обеспечивает актуальность справочных данных систем автоматизации бюджетного процесса;
• обеспечивает взаимодействие системы автоматизации бюджетного процесса со сторонним программным обеспечением;
• исполняет функцию организатора автоматизированного взаимодействия министерства с федеральными органами исполнительной власти.